Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TSC1Q92574 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC1Q92574 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms