Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCSTNQ92542 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms