Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC107Q8WV48 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC107Q8WV48 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms