Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GIPC3Q8TF64 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIPC3Q8TF64 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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