Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HELQQ8TDG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HELQQ8TDG4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms