Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER1Q8TC90 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms