Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GADD45GIP1Q8TAE8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GADD45GIP1Q8TAE8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GADD45GIP1Q8TAE8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1Q8TAE8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1Q8TAE8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1Q8TAE8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms