Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEST2Q8NFU1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEST2Q8NFU1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEST2Q8NFU1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms