Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC89Q8N998 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC89Q8N998 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms