Protein–RNA interactions for Protein: Q8N819

PPM1N, Probable protein phosphatase 1N, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1NQ8N819 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPM1NQ8N819 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPM1NQ8N819 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PPM1NQ8N819 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPM1NQ8N819 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1NQ8N819 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms