Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC9Q8N567 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZCCHC9Q8N567 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC9Q8N567 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms