Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SVBPQ8N300 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVBPQ8N300 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms