Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00269Q8N2A0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00269Q8N2A0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms