Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXZ3

SP8, Transcription factor Sp8, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP8Q8IXZ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP8Q8IXZ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SP8Q8IXZ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SP8Q8IXZ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms