Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF39Q86UA1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF39Q86UA1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF39Q86UA1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms