Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2Q1Q7Z7E8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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