Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP2Q7RTS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP2Q7RTS6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms