Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27LQ71UM5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS27LQ71UM5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms