Protein–RNA interactions for Protein: Q70E73

RAPH1, Ras-associated and pleckstrin homology domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPH1Q70E73 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAPH1Q70E73 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAPH1Q70E73 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms