Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM43BQ6ZT52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM43BQ6ZT52 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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