Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9BQ6WBX8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9BQ6WBX8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD9BQ6WBX8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms