Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PACS1Q6VY07 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PACS1Q6VY07 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms