Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC171Q6TFL3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC171Q6TFL3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC171Q6TFL3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms