Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GALNT18Q6P9A2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALNT18Q6P9A2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms