Protein–RNA interactions for Protein: Q6P995

FAM171B, Protein FAM171B, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM171BQ6P995 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM171BQ6P995 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171BQ6P995 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171BQ6P995 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms