Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C22orf39Q6P5X5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C22orf39Q6P5X5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms