Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC41PQ6P2S7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TTC41PQ6P2S7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC41PQ6P2S7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms