Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.61e-13■■■■■ 50.6
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PRPF8Q6P2Q9 KCTD7-203ENST00000449064 538 ntTSL 410.98□□□□□ -0.651e-13■■■■■ 50.6
PRPF8Q6P2Q9 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.676e-17■■■■■ 50.6
PRPF8Q6P2Q9 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.714e-26■■■■■ 50.6
PRPF8Q6P2Q9 KCTD7-211ENST00000640851 3745 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.891e-13■■■■■ 50.6
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PRPF8Q6P2Q9 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.684e-7■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 PPT2-EGFL8-205ENST00000479001 944 ntTSL 58.05□□□□□ -1.121e-10■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.738e-8■■■■■ 50.2
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PRPF8Q6P2Q9 KIZ-205ENST00000611685 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.15□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.713e-9■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 KIZ-210ENST00000619189 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.963e-9■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 DENND4C-201ENST00000361024 3463 ntTSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 C8orf59-204ENST00000523245 799 ntTSL 25.48□□□□□ -1.532e-7■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.022e-7■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.142e-7■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.252e-7■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.342e-7■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.432e-7■■■■■ 50.2
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