Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATL3Q6DD88 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATL3Q6DD88 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATL3Q6DD88 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms