Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM68Q6AZZ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM68Q6AZZ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM68Q6AZZ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms