Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CLQ60I27 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CLQ60I27 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms