Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZB9

DMRTA1, Doublesex- and mab-3-related transcription factor A1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRTA1Q5VZB9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DMRTA1Q5VZB9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DMRTA1Q5VZB9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms