Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BROXQ5VW32 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms