Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms