Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGSNQ5TDP6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGSNQ5TDP6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms