Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZFYVE27Q5T4F4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms