Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL5A1-AS1Q5SY13 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms