Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SAMD9Q5K651 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
SAMD9Q5K651 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SAMD9Q5K651 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms