Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCID2Q5JVF3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms