Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD3Q5JV73 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD3Q5JV73 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms