Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XKR3Q5GH77 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR3Q5GH77 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms