Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGO2Q562F6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms