Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1BQ53T94 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms