Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HS1BP3Q53T59 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HS1BP3Q53T59 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HS1BP3Q53T59 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms