Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP29Q52LW3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP29Q52LW3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms