Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTU2Q2VPK5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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