Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTC1Q2NKJ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTC1Q2NKJ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms