Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPROQ16827 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPROQ16827 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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