Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN21Q16825 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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