Protein–RNA interactions for Protein: Q16630

CPSF6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF6Q16630 HNRNPR-207ENST00000470941 560 ntTSL 46.29□□□□□ -1.41e-7■□□□□ 8.5
CPSF6Q16630 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.511e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.31e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 MKLN1-209ENST00000494785 2386 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 IGFL2-AS1-201ENST00000594027 294 ntTSL 310.52□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 IGFL2-AS1-205ENST00000599817 340 ntTSL 210.19□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 MKLN1-206ENST00000458153 2448 ntTSL 28.04□□□□□ -1.121e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SEPT11-208ENST00000506731 659 ntTSL 57.98□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SEPT11-202ENST00000502401 276 ntTSL 56.45□□□□□ -1.381e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SEPT11-212ENST00000512575 587 ntTSL 46.41□□□□□ -1.381e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SEPT11-215ENST00000513697 328 ntTSL 26.03□□□□□ -1.441e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SEPT11-214ENST00000513373 546 ntTSL 25.45□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.911e-6■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.577e-9■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 RPL5-205ENST00000497519 1210 ntTSL 28.93□□□□□ -0.987e-9■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.095e-7■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 CCNB1-207ENST00000513102 463 ntTSL 27.39□□□□□ -1.235e-7■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 CCNB1-203ENST00000505500 1190 ntTSL 1 (best)6.82□□□□□ -1.325e-7■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 CCNB1-205ENST00000507798 767 ntTSL 36.7□□□□□ -1.345e-7■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SRPK1-201ENST00000346162 4762 ntTSL 215.28■□□□□ 0.043e-17■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-17■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SRPK1-202ENST00000361690 4286 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.843e-17■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.913e-17■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SRPK1-211ENST00000510290 621 ntTSL 37.83□□□□□ -1.163e-17■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 SRPK1-206ENST00000502969 370 ntTSL 37.21□□□□□ -1.263e-17■□□□□ 8.4
CPSF6Q16630 H3F3B-203ENST00000586518 1701 nt29.04■■■□□ 2.245e-12■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.125e-12■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.325e-12■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 H3F3B-213ENST00000593254 894 ntTSL 512.25□□□□□ -0.455e-12■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 H3F3B-212ENST00000592643 795 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.625e-12■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 H3F3B-210ENST00000591890 783 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.85e-12■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.115e-12■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.019e-15■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.029e-15■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.19e-15■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.369e-15■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.279e-15■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 STMN1-208ENST00000485226 449 ntTSL 25.87□□□□□ -1.479e-15■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 STMN1-207ENST00000465604 2947 ntTSL 1 (best)3.84□□□□□ -1.799e-15■□□□□ 8.2
CPSF6Q16630 PHF12-212ENST00000583524 1875 ntTSL 1 (best)26.75■■□□□ 1.873e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 PHF12-203ENST00000378879 2963 ntTSL 519.68■□□□□ 0.743e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.633e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.483e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 NAP1L4-211ENST00000526023 477 ntTSL 516.47■□□□□ 0.233e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.233e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 NAP1L4-209ENST00000492594 570 ntTSL 316.37■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 NAP1L4-207ENST00000469805 2294 ntTSL 315.87■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 314.99□□□□□ -0.011e-10■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 PHF12-217ENST00000589176 869 ntTSL 512.75□□□□□ -0.373e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-201ENST00000313117 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-206ENST00000431066 1847 ntTSL 510.65□□□□□ -0.73e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-208ENST00000443213 1903 ntTSL 510.19□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 PHF12-210ENST00000582655 2551 ntTSL 510.13□□□□□ -0.793e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-209ENST00000446327 2453 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-205ENST00000425941 1944 ntTSL 59.65□□□□□ -0.863e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 GABRE-208ENST00000483564 2747 ntTSL 38.83□□□□□ -13e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 GABRE-209ENST00000486255 6176 ntTSL 1 (best)8.67□□□□□ -1.023e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-204ENST00000425778 2857 ntTSL 28.51□□□□□ -1.053e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 PHF12-209ENST00000582436 5697 ntTSL 58.16□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 PHF12-216ENST00000584822 560 ntTSL 47.83□□□□□ -1.163e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.283e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 56.88□□□□□ -1.313e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 NUP160-209ENST00000530326 4811 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.02□□□□□ -1.443e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-210ENST00000452806 747 ntTSL 25.88□□□□□ -1.473e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-207ENST00000432873 603 ntTSL 35.85□□□□□ -1.473e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SLU7-207ENST00000521320 492 ntTSL 25.69□□□□□ -1.53e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-211ENST00000477635 680 ntTSL 25.64□□□□□ -1.513e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 BMP2K-203ENST00000502613 6902 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.613e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 SRSF7-212ENST00000487773 637 ntTSL 54.63□□□□□ -1.673e-6■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.566e-19■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.026e-19■□□□□ 8.1
CPSF6Q16630 CCT5-210ENST00000511995 1091 ntTSL 28.63□□□□□ -1.036e-19■□□□□ 8.1
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